Sequenziamento acque reflue: sottovarianti di Omicron BA.5 e BA5.2 sempre domaninanti

13 settembre 2022

Nella 36° settimana del 2022 (campionamenti del 5 settembre scorso) come nella settimana precedente, continua ad essere dominante la sottovariante di Omicron BA.5 (Clade 22B) nei depuratori di Castiglione Torinese e Novara. Per quanto riguarda i depuratori di Cuneo e Alessandria, la variante dominante risulta essere la sottovariante di Omicron BA.5.2.

In merito alla sottovariante Omicron BA.5, si conferma la presenza di mutazioni appartenenti alla sottovariante BA.5.2 in tutti i depuratori con frequenze differenti, in particolare:

a Castiglione Torinese si osserva la presenza di mutazioni specifiche e univoche a bassa frequenza appartenenti alle sottovarianti BA.5.1.5, BA.5.2.1 (BF) e BA.5.2.1.10 (BF.10);
a Cuneo si osservano mutazioni specifiche ed univoche a bassa frequenza per le sottovariante BA.5.2.1 (BF), BA.5.2.4 e BA.5.3.1.1 (BE.1);
a Novara si rileva la presenza di mutazioni specifiche ed univoche a bassa frequenza appartenenti alle sottovarianti BA.5.1, BA.5.2.1.5 (BF.5) e BA.5.3.1 (BE);
ad Alessandria sono state osservate mutazioni specifiche ed univoche a bassa frequenza appartenenti alla sottovariante BA.5.1.8, BA.5.2.1.6 (BF.6), BA.5.3 e BA.5.3.1.2 (BE.2).

In quanto alla sottovariante Omicron BA.4, continuano ad essere rilevate sue sottovarianti (Clade 22A) nei depuratori di Alessandria, Castiglione Torinese, Cuneo e Novara:

a Castiglione Torinese sono state osservate mutazioni specifiche ed univoche a bassa frequenza appartenenti alla sottovariante BA.4.1.8 e BA.4.6;
a Alessandria sono state osservate mutazioni specifiche ed univoche a bassa frequenza appartenenti alla sottovariante BA.4.1.6 e BA.4.1.8;
a Cuneo sono state osservate mutazioni specifiche ed univoche a bassa frequenza appartenenti alla sottovariante BA.4.6;
a Novara sono state osservate mutazioni specifiche ed univoche a bassa frequenza appartenenti alla sottovariante BA.4.7.

Degne di nota, infine, le mutazioni specifiche e univoche a bassa frequenza della sottovariante di Omicron BA.2.78 a Castiglione Torinese e le mutazioni specifiche e univoche a bassa frequenza della sottovariante ricombinante di Omicron XAN (ricombinante tra le sottovarianti BA.2 e BA.5.1) nel depuratore di Alessandria.

Non si osservano mutazioni specifiche per le sottovarianti Omicron BA.2.12.1 (Clade 22C), BA.2.75 (Clade 22D) e BA.3.

Proseguirà nelle prossime settimane il monitoraggio della situazione.