Sequenziamento acque reflue: Omicron BQ.1 e le sue sottovarianti dominanti nei depuratori del Piemonte

23 dicembre 2022

Nella 50° settimana del 2022, relativa ai campionamenti del 12 dicembre scorso, si ha la dominanza della sottovariante di Omicron BQ.1.1 (BA.5.3.1.1.1.1.1.1) (Clade 22E) nel depuratore di Castiglione Torinese, mentre nei depuratori di Cuneo e Novara la variante dominante è BQ.1.19 (BA.5.3.1.1.1.1.1.19) (Clade 22E) e nel depuratore di Alessandria BQ.1 (BA.5.3.1.1.1.1.1) (Clade 22E).

In merito alla sottovariante Omicron BA.5, sono state osservate mutazioni specifiche per la sottovariante BA.5.2.1.30 (BF.30) in tutti i depuratori; inoltre, nel dettaglio si riscontrano le seguenti sottovarianti:

nel depuratore di Alessandria sono state osservate mutazioni specifiche ed univoche con bassa frequenza appartenenti alle sottovarianti BT.1 (BA.5.1.21.1), BA.5.1.27, BF.7.4.1 (BA.5.2.1.7.4.1) e BQ.2 (BA.5.3.1.1.1.1.2);
nel depuratore di Novara si rileva la presenza di mutazioni specifiche ed univoche con bassa frequenza appartenenti alla sottovarianta BQ.1.15 (BA.5.3.1.1.1.1.1.15);
nel depuratore di Cuneo si osservano mutazioni specifiche ed univoche con bassa frequenza per le sottovarianti BA.5.1.29, BA.5.2.34, BQ.1.1.6 (BA.5.3.1.1.1.1.1.1.6) e BQ.1.1.18 (BA.5.3.1.1.1.1.1.1.18).

In merito alla sottovariante di Omicron BA.2, sono state osservate mutazioni specifiche a bassa frequenza per le sottovarianti:

BA.2.50 nel depuratore di Castiglione Torinese;
BA.2.3.8, BS.1.1 (BA.2.3.2.1.1) e BL.3 (BA.2.75.1.3) nel depuratore di Cuneo;
BA.2.13.1, BA.2.50 e mutazioni condivise tra le sottovarianti BM.4 (BA.2.75.3.4), BM.4.1, BM.4.1.1 (CH), CH.1 e CH.1.1 nel depuratore di Novara;
BA.2.77 nel depuratore di Alessandria.

Non si osservano mutazioni specifiche ed univoche per le sottovarianti Omicron BA.1, BA.3, BA.4 né per le sottovarianti ricombinanti.