Sequenziamento acque reflue: le varianti dominanti ad agosto 2023 nei depuratori del Piemonte
Nella 31° settimana, relativa ai campionamenti del 31 luglio 2023 per il depuratore di Castiglione Tornese, Novara e Cuneo la variante dominante è XBB.1.22 (Bellatrix – Clade 22F), mentre per i depuratori di Alessandria, l’analisi bioinformatica ha evidenziato un conflitto tra le sottovarianti XBB, XBB.1.5 (Kraken- Clade 23A) e XBB.2.4 per l’assegnazione della variante dominante.
Nella 32° settimana, relativa ai campionamenti del 7 agosto 2023, la variante dominante per tutti i depuratori è XBB.1.22 (Bellatrix – Clade 22F).
Nella 34° settimana, relativa ai campionamenti del 21 agosto 2023, per il depuratore di Alessandria la variante dominante è EG.5.1 (Eris – Clade 23F), per il depuratore di Novara è XBB.1.22 (Bellatrix – Clade 22F); per i depuratori di Castiglione Torinese e Cuneo l’analisi bioinformatica ha evidenziato un conflitto per l’assegnazione della variante dominante: per il depuratore di Castiglione Torinese tra le sottovarianti XBB.1.22 e XBB.1.9.1; per il depuratore di Cuneo tra le sottovarianti EG.5, XBB.1.22, XBB.1.9.1 e XBB.1.9.2.
Nella 35° settimana, relativa ai campionamenti del 28 agosto 2023, per il depuratore di Novara la variante dominante è XBB.1.22 (Bellatrix – Clade 22F), per il depuratore di Alessandria e Castiglione Torinese l’analisi bioinformatica ha evidenziato un conflitto per l’assegnazione della variante dominante tra le sottovarianti XBB.1.22 e XBB.1.9.1. I dati del depuratore di Cuneo non sono disponibili al momento.
Il grafico mostra nel dettaglio l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla settimana 49 del 2021 con cadenza settimanale per i quattro depuratori analizzati. Per ogni settimana, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte.
