Sequenziamento acque reflue: le varianti dominanti a settembre 2023 nei depuratori del Piemonte
Nella 36° settimana del 2023, relativa ai campionamenti del 4 settembre, per i depuratori di Alessandria e Castiglione Torinese la variante dominante è XBB.1.22 (Bellatrix – Clade 22F) e per il depuratore di Cuneo EG.5.1 (Eris), mentre per il depuratore di Novara l’analisi bioinformatica ha evidenziato un conflitto per l’assegnazione della variante dominante tra le sottovarianti XBB.1.22 (Bellatrix – Clade 22F) e XBB.1.9.1 (Hyperion).
Nella 37° settimana del 2023, relativa ai campionamenti dell'11 settembre, per i depuratori di Alessandria e Castiglione Torinese la variante dominante è XBB.1.9.1 (Hyperion); per i depuratori di Cuneo e Novara l’analisi bioinformatica ha evidenziato un conflitto per l’assegnazione della variante dominante: per il depuratore di Cuneo tra le sottovarianti XBB.1.22 (Bellatrix – Clade 22F) e XBB.1.9.1(Hyperion), mentre per il depuratore di Novara EG.5 (Eris), XBB.1.22 (Bellatrix – Clade 22F) e XBB.1.9.1(Hyperion).
Nella 38° settimana del 2023, relativa ai campionamenti del 18 settembre) per il depuratore di Alessandria la variante dominante è XBB.1.9.2, per il depuratore di Castiglione Torinese è EG.5 (Eris), per il depuratore di Novara è XBB.1.9.1(Hyperion), per il depuratore di Cuneo XBB.1.22 (Bellatrix – Clade 22F).
Nella 39° settimana del 2023, relativa ai campionamenti del 25 settembre, per il depuratore di Alessandria la variante dominante è EG.5 (Eris), per il depuratore di Cuneo XBB.1.22(Bellatrix – Clade 22F), per i depuratori di Castiglione Torinese e Novara è XBB.1.9.1 (Hyperion). Data la rilevanza epidemiologica, si evidenzia inoltre che sono state rilevate a bassa frequenza, mutazioni riferite alla variante BA.2.86 (cosiddetta Pirola, definita come Variant Under Monitoring da OMS) nel depuratore di Novara.
Il grafico mostra nel dettaglio l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla settimana 49 del 2021 con cadenza settimanale per i quattro depuratori analizzati. Per ogni settimana, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte.
