Sequenziamento acque reflue: le varianti dominanti a ottobre 2023 nei depuratori del Piemonte
Nella 40° settimana del 2023, relativa ai campionamenti del 2 ottobre, per i depuratori di Alessandria, Castiglione Torinese e Novara la variante dominante è XBB.1.9.1 (Hyperion – Clade 23D), per il depuratore di Cuneo l’analisi bioinformatica ha evidenziato un conflitto per l’assegnazione della variante dominante tra le sottovarianti XBB.1.22 (Bellatrix) e XBB.1.9.1 (Hyperion).
Nella 41° settimana del 2023, relativa ai campionamenti del 9 ottobre, per i depuratori di Alessandria e Novara la variante dominante è XBB.1.9.1; per gli altri depuratori l’analisi bioinformatica ha evidenziato un conflitto per l’assegnazione della variante dominante: per il depuratore di Castiglione Torinese tra le sottovarianti XBB.1.22 e XBB.1.9.1; per il depuratore di Cuneo tra le sottovarianti EG.5 (Eris), XBB.1.22 e XBB.1.9.1.
Nella 42° settimana del 2023, relativa ai campionamenti del 16 ottobre,per i depuratori di Alessandria e Novara la variante dominante è XBB.1.9.1, per il depuratore di Cuneo è EG.5: per il depuratore di Castiglione Torinese l’analisi bioinformatica ha evidenziato un conflitto per l’assegnazione della variante dominante tra le sottovarianti XBB.1.22 e XBB.1.9.1.
Nella 43° settimana del 2023, relativa ai campionamenti del 23 ottobre, per il depuratore di Cuneo la variante dominante è EG.5, per i depuratori di Alessandria, Castiglione Torinese e Novara l’analisi bioinformatica ha evidenziato un conflitto per l’assegnazione della variante dominante tra le sottovarianti XBB.1.22 e XBB.1.9.1.
Data la rilevanza epidemiologica, si comunica inoltre che è stata rilevata, a bassa frequenza, la variante BA.2.86 (cosiddetta Pirola, Variant Under Monitoring VUM secondo WHO) e di alcune sue sottovarianti in tutti i depuratori.
Nelle successive tabelle la situazione riassunta per ogni singolo depuratore:
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Depuratore di Alessandria |
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Settimane - anno |
40-2023 |
41-2023 |
42-2023 |
43-2023 |
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Variante dominante |
XBB.1.9.1 |
XBB.1.9.1 |
XBB.1.9.1 |
Conflitto: XBB.1.22 e XBB.1.9.1 |
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Depuratore di Castiglione Torinese |
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Settimane - anno |
40-2023 |
41-2023 |
42-2023 |
43-2023 |
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Variante dominante |
XBB.1.9.1 |
Conflitto: XBB.1.22 e XBB.1.9.1 |
Conflitto: XBB.1.22 e XBB.1.9.1 |
Conflitto: XBB.1.22 e XBB.1.9.1 |
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Depuratore di Novara |
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Settimane - anno |
40-2023 |
41-2023 |
42-2023 |
43-2023 |
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Variante dominante |
XBB.1.9.1 |
XBB.1.9.1 |
XBB.1.9.1 |
Conflitto: XBB.1.22 e XBB.1.9.1 |
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Depuratore di Cuneo |
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Settimane - anno |
40-2023 |
41-2023 |
42-2023 |
43-2023 |
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Variante dominante |
Conflitto: XBB.1.22 e XBB.1.9.1 |
Conflitto: EG.5, XBB.1.22 e XBB.1.9.1. |
EG.5 |
EG.5.1 |
Il grafico mostra nel dettaglio l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla settimana 49 del 2021 con cadenza settimanale per i quattro depuratori analizzati. Per ogni settimana, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte.
Il report dettagliato delle sottovarianti di Omicron ritrovate nei depuratori del Piemonte nel mese di ottobre.