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Sequenziamento acque reflue: le varianti dominanti a novembre 2023 nei depuratori del Piemonte

12 dicembre 2023

Nella 44° settimana del 2023, relativa ai campionamenti del 30 ottobre, per i depuratori di Novara e Cuneo la variante dominante è EG.5.1 (Eris) per il depuratore di Alessandria è XBB.1.9.1 (Hyperion – Clade 23D); per il depuratore di Castiglione Torinese l’analisi bioinformatica ha evidenziato un conflitto per l’assegnazione della variante dominante tra le sottovarianti XBB.1.22 (Bellatrix) e XBB.1.9.1.

Nella 45° settimana del 2023, relativa ai campionamenti del 6 novembre, per i depuratori di Alessandria e Castiglione Torinese la variante dominante è XBB.1.9.1, per il depuratore di Cuneo è EG.5, mentre per il depuratore di Novara è EG.5.1.

Nella 46° settimana del 2023, relativa ai campionamenti del 13 novembre, per tutti i depuratori la variante dominante è XBB.1.9.1.

Nella 47° settimana del 2023, relativa ai campionamenti del 20 novembre, per i depuratori di Alessandria e Castiglione Torinese la variante dominante è XBB.1.9.1, per il depuratore di Cuneo è EG.5; per il depuratore di Novara l’analisi bioinformatica ha evidenziato un conflitto per l’assegnazione della variante dominante tra le sottovarianti EG.5.1 e XBB.1.9.1.

Data la rilevanza epidemiologica, si comunica inoltre che sono state rilevate, con frequenza in aumento, le varianti BA.2.86.1 (JN) e JN.1, sottovarianti della variante BA.2.86 (cosiddetta Pirola, classificata  Variant of Interest VOI secondo WHO dal 21/11/2023) in tutti i depuratori.

Nelle successive tabelle la situazione riassunta per ogni singolo depuratore:

Depuratore di Alessandria

Settimane - anno

44-2023

45-2023

46-2023

47-2023

Variante dominante

XBB.1.9.1

XBB.1.9.1

XBB.1.9.1

XBB.1.9.1

 

Depuratore di Castiglione Torinese

Settimane - anno

44-2023

45-2023

46-2023

47-2023

Variante dominante

Conflitto: XBB.1.22 e XBB.1.9.1

XBB.1.9.1

XBB.1.9.1

XBB.1.9.1

 

Depuratore di Novara

Settimane - anno

44-2023

45-2023

46-2023

47-2023

Variante dominante

EG.5.1

EG.5.1

XBB.1.9.1

Conflitto: XBB.1.9.1 e EG.5.1

 

Depuratore di Cuneo

Settimane - anno

44-2023

45-2023

46-2023

47-2023

Variante dominante

EG.5.1

EG.5

XBB.1.9.1

EG.5

 Il grafico mostra nel dettaglio l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla settimana 49 del 2021 con cadenza settimanale per i quattro depuratori analizzati. Per ogni settimana, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte.

grafico varianti pango data v1.22 settimane 44 45 46 47

Il report dettagliato delle sottovarianti di Omicron ritrovate nei depuratori del Piemonte nel mese di novembre.

 

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