Sequenziamento acque reflue: le varianti dominanti a dicembre 2023 nei depuratori del Piemonte
Nella 48° settimana del 2023, relativa ai campionamenti del 27 novembre 2023 per i depuratori di Alessandria e Castiglione Torinese la variante dominante è BA.2, per il depuratore di Cuneo è XBB.1.5 (Kraken – Clade 23A); per il depuratore di Novara l’analisi bioinformatica ha evidenziato un conflitto per l’assegnazione della variante dominante tra le sottovarianti XBB.1.5 (Kraken) e XBB.1.9.1 (Hyperion – Clade 23D).
Nella 49° settimana del 2023, relativa ai campionamenti del 4 dicembre, per i depuratori di Alessandria e Castiglione Torinese la variante dominante è BA.2; per i depuratori di Cuneo e Novara l’analisi bioinformatica ha evidenziato un conflitto per l’assegnazione della variante dominante tra le sottovarianti BA.2 e XBB.1.5 (Kraken).
Nella 50° settimana del 2023, relativa ai campionamenti dell'11 dicembre, per i depuratori di Castiglione Torinese e Novara la variante dominante è BA.2, mentre per i depuratori di Alessandria e Cuneo è BA.2.86.1 (JN).
Nella 51° settimana del 2023, relativa ai campionamenti del 18 dicembre, per il depuratore di Castiglione Torinese la variante dominante è BA.2.86.1 (JN), per i depuratori di Alessandria, Cuneo e Novara è JN.1, classificata come “Variant of Interest” VOI secondo WHO dal 18/12/2023
Nelle successive tabelle la situazione riassunta per ogni singolo depuratore:
|
Depuratore di Alessandria |
||||
|
Settimane - anno |
48-2023 |
49-2023 |
50-2023 |
51-2023 |
|
Variante dominante |
BA.2 |
BA.2 |
BA.2.86.1 (JN) |
JN.1 |
|
Depuratore di Castiglione Torinese |
||||
|
Settimane - anno |
48-2023 |
49-2023 |
50-2023 |
51-2023 |
|
Variante dominante |
BA.2 |
BA.2 |
BA.2 |
BA.2.86.1 (JN) |
|
Depuratore di Novara |
||||
|
Settimane - anno |
48-2023 |
49-2023 |
50-2023 |
51-2023 |
|
Variante dominante |
Conflitto: XBB.1.5 e XBB.1.9.1 |
Conflitto: BA.2 e XBB.1.5 |
BA.2 |
JN.1 |
|
Depuratore di Cuneo |
||||
|
Settimane - anno |
48-2023 |
49-2023 |
50-2023 |
51-2023 |
|
Variante dominante |
XBB.1.5 |
Conflitto: BA.2 e XBB.1.5 |
BA.2.86.1 (JN) |
JN.1 |
Il grafico a linee mostra l’andamento della sottovariante JN.1 (BA.2.86.1.1) dalla comparsa delle sue mutazioni (settimana 44-2023) nei 4 depuratori analizzati.
Il grafico seguente invece mostra nel dettaglio l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla settimana 49 del 2021 con cadenza settimanale per i quattro depuratori analizzati. Per ogni settimana, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte.
Il report dettagliato delle sottovarianti di Omicron ritrovate nei depuratori del Piemonte nel mese di dicembre.