Sequenziamento acque reflue: le sottovarianti BA.5 e BA.5.2 sempre dominanti

11 ottobre 2022

Nella 40° settimana del 2022, relativa ai campionamenti del 3 ottobre scorso, si ha la dominanza della sottovariante di Omicron BA.5 (Clade 22B) nei depuratori di Castiglione Torinese ed Alessandria. Per quanto riguarda i depuratori di Cuneo e Novara, la variante dominante risulta essere la sottovariante di Omicron BA.5.2.

In merito alla sottovariante Omicron BA.5, si riscontrano mutazioni univoche e specifiche appartenenti ad essa ed alle sue sottovarianti BA.5.2.1 (BF), BA.5.3.1 (BE), BA.5.3.1.1 (BE.1), BA.5.3.1.1.1 (BE.1.1) BA.5.6.2 (BW), in tutti i depuratori con frequenze differenti.

Nel dettaglio:

-nel depuratore di Castiglione Torinese si osserva la presenza di mutazioni specifiche e univoche con bassa frequenza appartenenti alle sottovarianti BA.5.1.10 (BK), BA.5.2.1.7 (BF.7), BA.5.1.5;

- nel depuratore di Cuneo si osservano mutazioni specifiche ed univoche con bassa frequenza per le sottovarianti BA.5.2.1.7 (BF.7), BA.5.1.5, BA.5.1.14, BA.5.5.1;

- nel depuratore di Novara si rileva la presenza di mutazioni specifiche ed univoche con bassa frequenza appartenenti alle sottovarianti BA.5.1.10 (BK), BA.5.10;

- nel depuratore di Alessandria sono state osservate mutazioni specifiche ed univoche con bassa frequenza appartenenti alla sottovariante BA.5.1.10 (BK).

Mutazioni della sottovariante di Omicron BA.4 e sue sottovarianti (Clade 22A) sono presenti in tutti i depuratori.

Nel dettaglio:

- nel depuratore di Alessandria sono state osservate mutazioni specifiche ed univoche con bassa frequenza appartenenti alle sottovarianti BA.4.1.2 e BA.4.3;

- nel depuratore di Castiglione Torinese, Cuneo e Novara si rileva la presenza di mutazioni specifiche ed univoche con bassa frequenza appartenenti alla sottovariante BA.4.6.

Mutazioni con bassa frequenza della sottovariante di Omicron BA.2.75 (Clade 22D) sono state identificate nei depuratori di Alessandria, Castiglione Torinese e Novara. Mutazioni specifiche ed univoche della sottovariante BA.2.75.4 (BR) sono state identificate nel depuratore di Novara.

Mutazioni con bassa frequenza della sottovariante di Omicron BA.2.38.3 (BH) e BA.2.10.4 (Clade 21L) sono state identificate nel depuratore di Cuneo.

È stata rilevata la presenza di mutazioni univoche e specifiche con bassa frequenza appartenenti alla sottovariante ricombinante XV (ricombinante tra BA.1 e BA.2), XAB (ricombinante tra BA.1 e BA.2) nel depuratore di Alessandria.

Non si osservano mutazioni specifiche per le sottovarianti Omicron BA.3, BA.2.12.1 e BG (Clade 22C).