Sequenziamento acque reflue: le sottovarianti BA.5 e BA.5.2 continuano ad essere dominanti
Nella 39° settimana del 2022, relativa ai campionamenti del 26 settembre scorso, si ha la dominanza della sottovariante di Omicron BA.5 (Clade 22B) nei depuratori di Castiglione Torinese, Alessandria e Cuneo. Per quanto riguarda il depuratore di Novara, la variante dominante risulta essere la sottovariante di Omicron BA.5.2.
In merito alla sottovariante Omicron BA.5, si riscontrano mutazioni univoche e specifiche appartenenti ad essa ed alle sue sottovarianti in tutti i depuratori rilevate con frequenze differenti.
Nel dettaglio:
- nel depuratore di Castiglione Torinese si osserva la presenza di mutazioni specifiche e univoche con bassa frequenza appartenenti alle sottovarianti BA.5.2.1.5 (BF.5), BA.5.3.1.1 (BE.1) e BA.5.3.1.1.1 (BE.1.1);
- nel depuratore di Cuneo si osservano mutazioni specifiche ed univoche con bassa frequenza per le sottovariante BA.5.1.5, BA.5.2.1 (BF), BA.5.2.1.5 (BF.5), BA.5.2.1.8 (BF.8), BA.5.3.1.1 (BE.1) e BA.5.3.1.1.1 (BE.1.1);
- nel depuratore di Novara si rileva la presenza di mutazioni specifiche ed univoche con bassa frequenza appartenenti alle sottovarianti BA.5.3.1.1.1 (BE.1.1);
- nel depuratore di Alessandria sono state osservate mutazioni specifiche ed univoche con bassa frequenza appartenenti alla sottovariante BA.5.2.1 (BF) e BA.5.2.1.8 (BF.8).
Mutazioni della sottovariante di Omicron BA.4 e sue sottovarianti (Clade 22A) non sono più presenti in tutti i depuratori, ma solo nel depuratore di Alessandria. Nel dettaglio, ad Alessandria sono state osservate mutazioni specifiche ed univoche con bassa frequenza appartenenti alla sottovariante BA.4.1.2 e BA.4.6.
Mutazioni con bassa frequenza della sottovariante di Omicron BA.3 sono state individuate nel depuratore di Alessandria e BA.3.1 nel depuratore di Castiglione Torinese .
Mutazioni con bassa frequenza della sottovariante di Omicron BA.2.75 (Clade22D) sono state identificate in tutti depuratori. Mutazioni specifiche ed univoche con bassa frequenza della sottovariante BA.2.75.4 (BR) sono state identificate nel depuratore di Alessandria e Novara. Nel depuratore di Novara è stata riscontrata una mutazione specifica ed univoca con bassa frequenza della sottovariante BA.2.75.1 (BL.1).
È stata rilevata la presenza di mutazioni univoche e specifiche con bassa frequenza appartenenti alla sottovariante ricombinante XH (ricombinante tra BA.1 e BA.2) nel depuratore di Cuneo, XY (ricombinante tra BA.1 e BA.2) nel depuratore di Novara e XAN (ricombinante tra BA.2 e BA.5.1) nel depuratore di Alessandria.
Non si osservano mutazioni specifiche per le sottovarianti Omicron BA.2.12.1 e BG (Clade 22C).
Il laboratorio di biologia molecolare di Arpa Piemonte continuerà a monitorare la situazione nelle prossime settimane.