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Sequenziamento acque reflue: la sottovariante Omicron XBB.1 dominante in quasi tutti i depuratori del Piemonte

17 marzo 2023

Nella 9° e 10° settimana del 2023, relative ai campionamenti del 27 febbraio e del 6 marzo scorsi, continuano a vedersi dominanze di diverse sottovarianti, ma inizia ad essere prevalente la XBB.1.

Nel dettaglio:

-          nella nona settimana si ha la dominanza della sottovariante di Omicron BA.2 (Clade 21L) nel depuratore di Cuneo, mentre nel depuratore di Alessandria, Castiglione Torinese e Novara la variante dominante è XBB.1 (Clade 22F);

-          nella decima settimana si ha la dominanza della sottovariante di Omicron XBB.1 (Clade 22F) nel depuratore di Alessandria, Castiglione Torinese e Novara, mentre nel depuratore di Cuneo la variante dominante è XBB.1.5 (Clade 22F).

Di seguito sono riportate le tabelle descriventi le sottovarianti di Omicron ritrovate con bassa frequenza per ciascun depuratore.

Depuratore di Alessandria

reflueal16032023

Depuratore di Cuneo

refluecn16032023

Depuratore di Novara

reflueno16032023

Depuratore di Torino (Castiglione Torinese)

reflueto16032023

 

Non si osservano mutazioni specifiche ed univoche per la sottovariante Omicron BA.3.

Il grafico sottostante mostra nel dettaglio l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla settimana 49 del 2021 con cadenza settimanale per i 4 depuratori analizzati. Per ogni settimana, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte.

week 9 10 2023 dominant variants

 

 

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