Sequenziamento acque reflue: dominante sottovariante BA.2. Non individuabile la variante XE

Gli esiti delle analisi di sequenziamento riferiti ai campioni dell'ultima settimana, prelevati il 4 aprile scorso nei depuratori di Castiglione Torinese, Alessandria, Cuneo e Novara, hanno evidenziato tutti la dominanza della sottovariante BA.2.

Continuano a non essere rilevate mutazioni specifiche appartenenti alla sottovariante BA.3.

In quanto alle sequenze ricombinanti di SARS-CoV-2 (ad. esempio: XA,XB,XC,XD,XE,XF), particolare evidenza è stata data nelle notizie di settore alla ricombinante XE, composta da una parte di genoma di BA.1 (Omicron1) e una parte di genoma di BA.2 (Omicron 2).

Tali ricombinazioni del genoma virale di SARS-CoV-2 sono state individuate in singoli tamponi nasofaringei, mentre nel contesto del monitoraggio di sequenze di SARS-CoV-2 nelle acque reflue, ad oggi non è possibile affermare o escludere la presenza di ricombinanti del virus SARS-CoV-2 in quanto tale matrice presenta sequenze derivanti da più individui infettati da varianti differenti.

Solo quando un ricombinante sarà dominante e non ci saranno mutazioni associate ad altre varianti nella stessa parte del genoma ricombinato, si potrà affermare la presenza del solo ricombinante nelle acque reflue.