Sequenziamento acque reflue: dominante la sottovariante Kraken ma presenti più sottovarianti
Nella 21° settimana, relativa ai campionamenti del 22 maggio 2023, per i depuratori di Castiglione Torinese e Novara e nella 22° settimana, relativa ai campionamenti del 29 maggio 2023, per il solo depuratore di Castiglione Torinese (dati del depuratore di Cuneo attualmente non disponibili), si ha la dominanza della sottovariante XBB.1.5 (Kraken- Clade 23A).
Per gli altri depuratori analizzati, l’analisi bioinformatica ha evidenziato i seguenti conflitti per l’assegnazione della variante dominante:
- Settimana 21: Alessandria (XBB.1, XBB.1.5); Cuneo (XBB.1.22 (Bellatrix), XBB.1.5);
- Settimana 22: Alessandria (XBB.1.22, XBB.1.9.1 (Hyperion)); Novara (XBB.1.22, XBB.1.5).
Di seguito sono riportate le tabelle descriventi le sottovarianti di Omicron ritrovate con bassa frequenza per ciascun depuratore.
Depuratore di Alessandria
Depuratore di Castiglione Torinese - Torino
Depuratore di Cuneo
Depuratore di Novara
Non si osservano mutazioni specifiche ed univoche per la sottovariante Omicron BA.3.
Il grafico mostra nel dettaglio l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla settimana 49 del 2021 con cadenza settimanale per i quattro depuratori analizzati. Per ogni settimana, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte.
