Sequenziamento acque reflue: dominante la sottovariante XBB.1.5 (Kraken)
Nella 13° e 14° settimana del 2023, la sottovariante XBB.1.5 (Kraken) è dominante nella maggior parte dei depuratori piemontesi analizzati.
Nel dettaglio:
- nella tredicesima settimana si ha la dominanza della sottovariante XBB.1.5 (Clade 23A) in tutti i depuratori analizzati (Alessandria, Castiglione Torinese, Cuneo, Novara);
- nella quattordicesima settimana si ha la dominanza della sottovariante di Omicron XBB.1.5 (Clade 23A) nei depuratori di Alessandria e Novara. Per quanto riguarda il depuratore di Castiglione Torinese, l’analisi bioinformatica evidenzia un conflitto per individuare la sottovariante dominante, in quanto metà delle mutazioni corrispondono alla sottovariante XBB.1.5 e l’altra metà alla sottovariante XBB.1.22. Invece, per il depuratore di Cuneo, metà delle mutazioni corrispondono alla sottovariante XBB.1.5 e l’altra metà alla sottovariante XBB.1.9.1 (Hyperion).
Di seguito sono riportate le tabelle descriventi le sottovarianti di Omicron ritrovate con bassa frequenza per ciascun depuratore.
Depuratore di Alessandria
Depuratore di Castiglione Torinese - Torino
Depuratore di Cuneo
Depuratore di Novara
Non si osservano mutazioni specifiche ed univoche per la sottovariante Omicron BA.3 e BA.4.
Il grafico mostra nel dettaglio l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla settimana 49 del 2021 con cadenza settimanale per i 4 depuratori analizzati. Per ogni settimana, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte.
