Sequenziamento acque reflue: dominante la sottovariante XBB.1.5 (Kraken) in tutti i depuratori analizzati
Nella 15° e 16° settimana del 2023, relative ai campionamenti dell'11 e del 17 aprile 2023, la sottovariante XBB.1.5 (Kraken) è dominante in tutti i depuratori piemontesi analizzati.
Nel dettaglio: in entrambe le settimane si ha la dominanza della sottovariante XBB.1.5 (Clade 23A) nei depuratori di Castiglione Torinese, Cuneo e Novara. Per quanto riguarda il depuratore di Alessandria, l’analisi bioinformatica evidenzia un conflitto per individuare la sottovariante dominante, in quanto metà delle mutazioni corrispondono alla sottovariante XBB.1.5 e l’altra metà alla sottovariante XBB.1.22.
Di seguito sono riportate le tabelle descriventi le sottovarianti di Omicron ritrovate con bassa frequenza per ciascun depuratore.
Depuratore di Alessandria
Depuratore di Castiglione Torinese - Torino
Depuratore di Cuneo
Depuratore di Novara
In giallo è evidenziata la variante XBB.1.16 cosiddetta Arcturus designata in data 22-03-2023 come VUM (Variant Under Monitoring) mentre in data 17-04-2023 è stata aggiornata come VOI (Variant Of Interest) (https://www.who.int/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants). Questa variante è stata individuata per la prima volta nella 12° settimana del 2023 solo nel depuratore di Alessandria.
Non si osservano mutazioni specifiche ed univoche per la sottovariante Omicron BA.3.
Il grafico mostra nel dettaglio l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla settimana 49 del 2021 con cadenza settimanale per i 4 depuratori analizzati. Per ogni settimana, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte.
