Sequenziamento acque reflue: diverse varianti dominanti
Nella 22° settimana del 2023, relativa ai campionamenti del 29 maggio, nel depuratore di Cuneo l’analisi bioinformatica ha evidenziato un conflitto tra le sottovarianti XBB.1.22 (Bellatrix) e XBB.1.5 (Kraken- Clade 23A) per l’assegnazione della variante dominante.
Nella 23° settimana, relativa ai campionamenti del 5 giugno, per i depuratori di Alessandria, Novara e Cuneo l’analisi bioinformatica ha evidenziato un conflitto per l’assegnazione della variante dominante tra le sottovarianti XBB.1.22 (Bellatrix) e XBB.1.5 (Kraken- Clade 23A). Per il depuratore di Castiglione Torinese si ha invece la dominanza della sottovariante XBB.1.5 (Kraken- Clade 23A).
Nella 24° settimana , relativa ai campionamenti del 12 giugno, per il depuratore di Alessandria si ha la dominanza della sottovariante XBB.1.9.2, per Castiglione Torinese XBB.1.5 (Kraken- Clade 23A) e per Novara XBB.1.22 (Bellatrix). I dati del depuratore di Cuneo non sono attualmente disponibili.
Di seguito sono riportate le tabelle descriventi le sottovarianti di Omicron ritrovate con bassa frequenza per ciascun depuratore.
Depuratore di Alessandria
Depuratore di Castiglione Torinese (Torino)
Depuratore Cuneo
Depuratore Novara
Non si osservano mutazioni specifiche ed univoche per la sottovariante Omicron BA.1.
Il grafico mostra nel dettaglio l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla settimana 49 del 2021 con cadenza settimanale per i quattro depuratori analizzati. Per ogni settimana, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte.
